64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1759 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  46.38 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  45.65 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  35.34 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  35.04 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  33.56 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  33.87 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  28.86 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  29.71 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  31.65 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  30.94 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  32.23 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  32.23 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  34 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  33.08 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 223 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  30.3 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  31.01 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  26.39 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  25.47 
 
 		 170 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 179 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 237 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  28.85 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  29.59 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 131 aa  40.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>