46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1953 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
142 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  34.4 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  29.58 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
167 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  30.71 
 
 
184 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  29.63 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
175 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  29.2 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
157 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.64 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.49 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 
204 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  26.42 
 
 
182 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
182 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  28.42 
 
 
170 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  24.63 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
223 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  35.56 
 
 
188 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  24.5 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  26.39 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  30.3 
 
 
226 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>