39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0584 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 142 aa  293  6e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 		 142 aa  246  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  83.69 
 
 		 142 aa  246  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  44.12 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  24.19 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  26.32 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  28.85 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  30.53 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  29.79 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28.95 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  23.48 
 
 		 219 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 223 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  34 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  23.68 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  26.56 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  34.78 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  21.17 
 
 		 211 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>