36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000259 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  296  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
142 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
142 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
142 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  28 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
237 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  27.91 
 
 
211 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  27.91 
 
 
140 aa  50.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  30.3 
 
 
226 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
239 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
256 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  27.68 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  27.37 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  34.02 
 
 
179 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  31.76 
 
 
223 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 
226 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  28.81 
 
 
220 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  29.09 
 
 
318 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 
225 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  24.09 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  30.34 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
157 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>