75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1621 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  297  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  48.44 
 
 
132 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  48.44 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  47.66 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  35.77 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  36.75 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  36.54 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  42.39 
 
 
136 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
182 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  30.58 
 
 
220 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  33.71 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  29.1 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
225 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  31.45 
 
 
184 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  26.43 
 
 
164 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  32.94 
 
 
226 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  27.05 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  27.41 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 
204 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  37.68 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  31.63 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  31.4 
 
 
203 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 
169 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  34.12 
 
 
169 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
162 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
179 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
256 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  28.46 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
227 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  27.94 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
190 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  27.59 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
239 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  27.59 
 
 
215 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  28.46 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  28.15 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
158 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  27.59 
 
 
215 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
223 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 
164 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04261  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G03960)  29.46 
 
 
211 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.198707  normal  0.191547 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
226 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  32.53 
 
 
170 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  30.53 
 
 
318 aa  40.4  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  34.67 
 
 
162 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>