62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2200 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 175 aa  358  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  95.98 
 
 		 175 aa  344  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  36.44 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  40.7 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 223 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  44.32 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  31.67 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  32.63 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  30.53 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  28.38 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  34.13 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  34.55 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  33.64 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  32.22 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  35.71 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  30.91 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  31.82 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  25.71 
 
 		 316 aa  51.2  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  35.23 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  30.2 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 126 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  44.29 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 256 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 181 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  34.67 
 
 		 661 aa  41.6  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.59 
 
 		 138 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 		 161 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>