83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4838 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
169 aa  342  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
169 aa  342  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  79.52 
 
 
170 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  78.31 
 
 
170 aa  266  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  77.71 
 
 
170 aa  264  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 
190 aa  140  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  42.47 
 
 
179 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  39.07 
 
 
184 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  36.48 
 
 
179 aa  87  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  33.13 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  32.31 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  29.88 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  31.9 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  30.06 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  33.64 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  29.52 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  39.78 
 
 
211 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  35.16 
 
 
226 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  26.58 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 
223 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  30.13 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  30.57 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
136 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  29.59 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 
219 aa  48.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
226 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  30.77 
 
 
262 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
218 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  30.43 
 
 
203 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  27.74 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  34.12 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 
154 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
210 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  29.2 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  25.19 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
256 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
229 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 
210 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  28.16 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
239 aa  41.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
157 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 
132 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
142 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
142 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
131 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  25.47 
 
 
140 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>