55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1087 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  45.74 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  45.74 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  45.21 
 
 		 208 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2556  thioesterase superfamily protein  46.28 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3840  thioesterase superfamily protein  44.5 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4080  hypothetical protein  41.4 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.132207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  37.56 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  33.18 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3859  thioesterase superfamily protein  36.46 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0568373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4059  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.565547  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  31.98 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  30.89 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  26.04 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  31.37 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  30.65 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  25.89 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2595  hypothetical protein  32.2 
 
 		 155 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000992118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  28.65 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  28.93 
 
 		 262 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  31.46 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  33.96 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  33.96 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  33.96 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 150 aa  45.4  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 170 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  26.06 
 
 		 318 aa  42  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 170 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  28.97 
 
 		 184 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>