61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3856 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3856  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  52.5 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2807  thioesterase superfamily protein  52.71 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2793  thioesterase superfamily protein  52.71 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162268  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2763  thioesterase superfamily protein  52.71 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  49.75 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  50.5 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  50.25 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  50.54 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  50.54 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  50.54 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  44.27 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  49.17 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2911  thioesterase superfamily protein  43 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.139779  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  37.37 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  36.98 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2628  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 256 aa  86.3  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.666322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  36.61 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2825  thioesterase superfamily protein  31.05 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.401627  normal  0.0503956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5897  hypothetical protein  34.21 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.829788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2512  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.02847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1087  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0505  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 164 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0516  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  32.29 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 165 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0527  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 136 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0227  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0678  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 		 162 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  37.37 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10361  hypothetical protein  26.78 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.674059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  35.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  35.06 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3782  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  35.06 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  32.67 
 
 		 165 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  32.67 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  32.32 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0196  thioesterase family protein  29.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 170 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  29.81 
 
 		 156 aa  42  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  31.68 
 
 		 165 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 161 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>