68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3678 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  96.36 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  95.15 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  87.8 
 
 		 166 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  67.07 
 
 		 164 aa  237  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  41.78 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  40.74 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  45.95 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  40.43 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  41.54 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 		 158 aa  90.5  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 150 aa  87  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 153 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  39.57 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  31.82 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  30.06 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  30.06 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  35.58 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 		 134 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 132 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  31.33 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  28.48 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  36.08 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  28.32 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  29.58 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  29.25 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3596  hypothetical protein  32.5 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0435145  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  42.11 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  42.31 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  24.26 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 131 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  28.04 
 
 		 226 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2864  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.673484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>