61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2334 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  60.78 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  56.76 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  51.35 
 
 		 154 aa  160  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  47.71 
 
 		 166 aa  153  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  49.01 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  43.21 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  46.75 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  45.81 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  47.26 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  40.15 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  46.26 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  38.93 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  42.65 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  59.02 
 
 		 200 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  41.91 
 
 		 165 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  36.51 
 
 		 104 aa  82.8  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  41.18 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  36.81 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  38.17 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  35.21 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  34.31 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  36.56 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  31.82 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  31.25 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  27.89 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  40 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 225 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  28.16 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.95 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  26.36 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>