92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1672 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  73.64 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 		 131 aa  202  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1621  hypothetical protein  48.44 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  37.12 
 
 		 156 aa  95.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  48.35 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 146 aa  84.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1953  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1884  thioesterase  31.03 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  32.26 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  29.03 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000259  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  28.71 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  33.59 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  27.74 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 		 237 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  29.66 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3493  hypothetical protein  30.77 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  29.57 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1748  hypothetical protein  29.84 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 		 232 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  26.76 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1767  hypothetical protein  29.03 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1814  hypothetical protein  29.03 
 
 		 215 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.81198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  29.41 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  33.04 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1881  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4172  hypothetical protein  32.93 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.819256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  24.76 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  22.45 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  32.63 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2997  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 164 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00754086  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4288  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117284  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  26.43 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  39.34 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 155 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4585  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.515436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4570  thioesterase superfamily protein  29.07 
 
 		 189 aa  42.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177523 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4580  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.275413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  26.55 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0322  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 		 170 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.92516 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 159 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3049  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 		 208 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.221678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3328  thioesterase superfamily protein  28.75 
 
 		 208 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3319  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.17 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0286  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0277  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598204  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0296  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.642213 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  34.15 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3364  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4926  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4838  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.929773  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2736  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 219 aa  40.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198182  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  44.07 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.95 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0260  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 162 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>