261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1949 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  296  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  39.01 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 
160 aa  113  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  30.37 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.37 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
232 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  36.45 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.86 
 
 
160 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11565  hypothetical protein  31.37 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  30.22 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  30.22 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2108  thioesterase superfamily protein  38.68 
 
 
166 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  37.97 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0397  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  30.22 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  29.51 
 
 
152 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  29.91 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
135 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  29.93 
 
 
145 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
176 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  37.78 
 
 
139 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.75 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1469  hypothetical protein  27.59 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00236791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3386  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.220189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
165 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.17 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.66 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.66 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.66 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  28.8 
 
 
191 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.67 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.66 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  34.57 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  27.56 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  32.95 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  29.06 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  30.69 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  28.78 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  32.08 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
181 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.12 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  25.55 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4156  hypothetical protein  32.65 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488537  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3966  hypothetical protein  32.65 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  30.59 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.06 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
225 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  29.2 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  29.2 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  29.2 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  31.33 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
139 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  22.86 
 
 
139 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
137 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
304 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  39.39 
 
 
319 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1989  hypothetical protein  33.72 
 
 
211 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.762248  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>