183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2579 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
148 aa  309  9e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  28.15 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  25.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  32.28 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1469  hypothetical protein  31.2 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00236791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
232 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  28.57 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  25.64 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  26.83 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
142 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
189 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
159 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  22.7 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  29.73 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
183 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  27.05 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.87 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  24.29 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  29.73 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28.45 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  23.94 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  29.73 
 
 
179 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  25.64 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  27.27 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  26.89 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  28.71 
 
 
184 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  25.96 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  30.43 
 
 
156 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  27.27 
 
 
189 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  26.36 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 
182 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  26.05 
 
 
147 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 
127 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  26.97 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  24.17 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  27.59 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  26.27 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  26.77 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  21.67 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.5 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  26.27 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  27.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  27.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  26.27 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  28.32 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2019  thioesterase superfamily protein  27.37 
 
 
175 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.528281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  25.66 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  29.31 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  27.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  27.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  27.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  27.43 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  22.69 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  28.95 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  26.27 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  26.27 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  26.27 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  26.27 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  26.27 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  25.21 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  23.81 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  22.69 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  26.27 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  21.85 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25 
 
 
164 aa  44.3  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  23.73 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  22.69 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>