59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4445 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4445  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 166 aa  350  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3755  thioesterase superfamily protein  74.21 
 
 		 159 aa  241  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3410  hypothetical protein  64.6 
 
 		 165 aa  213  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.992808  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3627  thioesterase superfamily protein  57.79 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1838  thioesterase superfamily protein  64.6 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  57.89 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2382  thioesterase superfamily protein  53.74 
 
 		 157 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0657  thioesterase superfamily protein  52.87 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000228599 
 
 
-
 
NC_002950  PG1174  thioesterase family protein  51.61 
 
 		 165 aa  167  8e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2155  thioesterase superfamily protein  51.66 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1277  thioesterase superfamily protein  51.66 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2352  thioesterase superfamily protein  45.75 
 
 		 150 aa  147  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159316  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2334  thioesterase superfamily protein  47.71 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0822  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0102807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6840  thioesterase superfamily protein  49.66 
 
 		 151 aa  131  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1772  thioesterase superfamily protein  43.14 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8681  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1442  hypothetical protein  39.44 
 
 		 170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.395519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1101  hypothetical protein  72.58 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262671  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4105  hypothetical protein  46.85 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3678  hypothetical protein  45.95 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.200599  hitchhiker  0.00000369346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3379  hypothetical protein  40.74 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1759  hypothetical protein  45.95 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2375  hypothetical protein  38.46 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548775 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1097  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 		 159 aa  97.8  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1093  hypothetical protein  39.2 
 
 		 104 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.242255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3744  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.496409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1759  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.648149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3801  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3885  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.214372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4684  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3930  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165598  normal  0.974417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1487  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017643  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2418  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2434  hypothetical protein  31.69 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000212473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1445  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 		 204 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0379589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0920  thioesterase superfamily protein  37.25 
 
 		 225 aa  51.2  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.601386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6765  hypothetical protein  30.37 
 
 		 184 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0484171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15750  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000148622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1139  hypothetical protein  31.73 
 
 		 220 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1928  hypothetical protein  32.46 
 
 		 226 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.516207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2226  thioesterase superfamily protein  26.57 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4585  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.887435  normal  0.300583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1072  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 136 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2166  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37180  thioesterase superfamily enzyme  27.54 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.827725  normal  0.0700826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3967  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0213277  normal  0.386717 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1536  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 167 aa  45.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.333122  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1334  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151833  unclonable  3.30735e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0993  hypothetical protein  27.01 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 		 136 aa  44.7  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1672  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000631845  normal  0.966794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1636  thioesterase superfamily protein  26.14 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  34.67 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2200  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000154937 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34276  predicted protein  32.93 
 
 		 224 aa  40.8  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.021374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>