16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34276 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_34276  predicted protein  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.021374 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01196  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G10800)  30.29 
 
 
318 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  37.16 
 
 
316 aa  99.8  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31523  predicted protein  30.97 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.129639 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01747  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08890)  30.91 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.654216  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00181  conserved hypothetical protein  33.06 
 
 
317 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4659  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.358966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
154 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11106  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02390)  25.36 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
162 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0967  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
182 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0139902  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2846  thioesterase superfamily protein  30.38 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601576  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2279  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0327  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 
136 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000197485  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2240  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
208 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2287  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
208 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.395806  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>