239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4202 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
154 aa  310  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  59.03 
 
 
152 aa  174  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  58.62 
 
 
151 aa  168  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  52.6 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  52.6 
 
 
185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  52.6 
 
 
151 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  48.32 
 
 
169 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  45.27 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  47.95 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  47.68 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  43.54 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
153 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  47.83 
 
 
153 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  44.9 
 
 
146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 
162 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  43.15 
 
 
159 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  40.97 
 
 
148 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  42.86 
 
 
153 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 
142 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  40.88 
 
 
146 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 
138 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  44.88 
 
 
132 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  41.73 
 
 
155 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  45.87 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 
155 aa  90.9  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  42.11 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  36.3 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  39.34 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.86 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  36.28 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  38.17 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  38.21 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  35 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  38.38 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  37.4 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  36.22 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  36.23 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 
295 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  30.34 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  30.34 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
304 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  30.58 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
232 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.56 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  28.36 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  34.78 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.43 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  32.69 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  32.69 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  32.69 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.71 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  39 
 
 
187 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  35.2 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  41.1 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.08 
 
 
134 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  33.87 
 
 
191 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  37.63 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  34.02 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.49 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  40.4 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  32.69 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.97 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  27.13 
 
 
319 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.19 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 
301 aa  54.3  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  28.67 
 
 
199 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.71 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  23.9 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  34.38 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  34.71 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
204 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
136 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  28.57 
 
 
139 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  36.05 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  34.38 
 
 
159 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>