129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4483 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 141 aa  287  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  72.73 
 
 		 139 aa  196  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  55.8 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  35.59 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  35.59 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  36.19 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  37.14 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  38.05 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  38.05 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  38.05 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  37.96 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  36.11 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 		 155 aa  67  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  37.17 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  35.43 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  36.75 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  32.81 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  35.2 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  35.2 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  35.2 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  35.2 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  34.74 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  35.2 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  35.2 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  31.34 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.64 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  33.62 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  35.2 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  34.74 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31.03 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.88 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  29.27 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  30.11 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  26.09 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  28.33 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  38.78 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  34.11 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  29.25 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  38.78 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.2 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  26.05 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.83 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  24 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  27.61 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  36.94 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.96 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  27.48 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.14 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  32.61 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.91 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.42 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  27.59 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 146 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.4 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2973  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.118256  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>