204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0071 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
146 aa  298  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  55.22 
 
 
138 aa  147  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  54.55 
 
 
149 aa  144  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 
136 aa  138  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  43.48 
 
 
138 aa  103  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.48 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  32.48 
 
 
135 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.2 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.46 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.8 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.69 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  25.21 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  32.04 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  31 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.97 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
125 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
153 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  27.72 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
134 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.32 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
191 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  27.12 
 
 
134 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  27.12 
 
 
134 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  27.12 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
160 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3047  phenylacetic acid degradation protein PaaD  46.94 
 
 
156 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  28.46 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  36.97 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  29.1 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  32.56 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  33.72 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  36.97 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  28.91 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  28.7 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  36.45 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  27.88 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 
232 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3246  hypothetical protein  44.9 
 
 
172 aa  48.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  32.43 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  27.12 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  30.53 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  29.47 
 
 
238 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  26.36 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  29.79 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  25.42 
 
 
134 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  47.83 
 
 
153 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
154 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
181 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  27.13 
 
 
143 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  29.75 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  25.42 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  29.47 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  25.42 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  29.47 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
183 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3751  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.925886  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  29.47 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  25.42 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0027  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  29.47 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  51.06 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  29.47 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  25.42 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  23.14 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  29.47 
 
 
374 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  21.92 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  25.42 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  25.42 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  21.92 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  21.92 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>