125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3376 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
125 aa  260  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  37.39 
 
 
160 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
153 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  34.19 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.84 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  28.45 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  28.45 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
183 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  28.07 
 
 
159 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  29.67 
 
 
143 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  29.67 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
176 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0071  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 
146 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  28.16 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  33.68 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
170 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.59 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  33.75 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
161 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  36.14 
 
 
137 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
132 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  34.09 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  27.62 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
225 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  28.75 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
232 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  28.18 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  26.45 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  26.72 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  26.45 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  26.45 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  30.11 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  26.45 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.12 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21020  uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism  27.59 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.63 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  30.63 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1320  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0888357  hitchhiker  0.0000000634959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  30.59 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  25.49 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  26.5 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
127 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.93 
 
 
152 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  28.57 
 
 
374 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  30.43 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  26.09 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  27.72 
 
 
238 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  29.57 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  32.22 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  27.27 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  32 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  27.62 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  31.58 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  27.18 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  31.52 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.71 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  28.3 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  27.96 
 
 
138 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  25.45 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 
169 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
157 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
138 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  28.28 
 
 
179 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.57 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
165 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  32.93 
 
 
135 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  26.09 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  35.21 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  25.53 
 
 
334 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  32.93 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  26.6 
 
 
332 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  28.95 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
145 aa  40.8  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>