104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4897 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
143 aa  293  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  51.88 
 
 
137 aa  139  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  51.47 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  50.75 
 
 
141 aa  136  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  51.49 
 
 
145 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  51.13 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  36.84 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  35.34 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  34.04 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  34.4 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.2 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
126 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  32.97 
 
 
178 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
137 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
162 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.53 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.4 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  32.17 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  33 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.23 
 
 
148 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  38.89 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.98 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  36.78 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  26.96 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  22.73 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
165 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
144 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  35 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  30.08 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  28.32 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.03 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
173 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  33.91 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
304 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.9 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.67 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  28.44 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  28.85 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  34.74 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  33.68 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  33.94 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  26.72 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  31.48 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 
127 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  33.7 
 
 
319 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
144 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1299  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
133 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01870  mitochondrion protein, putative  32.94 
 
 
316 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.551385  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  32.97 
 
 
295 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 
209 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.64 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  28.3 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.01 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  30.3 
 
 
151 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  28.3 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  28.3 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.36 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>