77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2766 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 135 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  85.19 
 
 		 135 aa  244  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  31.67 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  27.48 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  25.4 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  27.13 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  26.15 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  25.58 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  25.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  29.63 
 
 		 166 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  36.17 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  27.17 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.73 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  36.67 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  29.29 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  32.38 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  28.07 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3799  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.254263  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  23.01 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  26.53 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  28.7 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  28.95 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  35.44 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  32.65 
 
 		 319 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  35.44 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 		 304 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  31.63 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.21 
 
 		 135 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  30.21 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 178 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  23.74 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  23.89 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5298  phenylacetic acid degradation-related protein  33.73 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  21.8 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  26.55 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  27.47 
 
 		 145 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>