85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5013 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  288  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  90.58 
 
 		 139 aa  260  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  84.78 
 
 		 139 aa  248  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  56.74 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  30.82 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  31.45 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.33 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  33.09 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29.06 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  31.67 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  23.94 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  26.23 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  26.95 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  30.51 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  30.51 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  31.91 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.25 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.23 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.25 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  24.17 
 
 		 127 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  29.46 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  34.67 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  38.3 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 154 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  36.99 
 
 		 148 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  29.17 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  34.74 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  29.81 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.96 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  29.79 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  32.14 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  26.88 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  31.91 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>