115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5172 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 141 aa  284  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  89.13 
 
 		 141 aa  257  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  65.67 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  50.39 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  48.84 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  38.17 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  39.69 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  40.77 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  36.92 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  30.25 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.54 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.66 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.66 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.95 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  31.97 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  31.5 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  29.75 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  34.41 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  31.2 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  29.93 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  27.59 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  22.4 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  27.93 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.79 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  29.37 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  29.91 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  28.44 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  27.35 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  32.28 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  27.05 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  22.81 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.87 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  26.23 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  21.05 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0829  hypothetical protein  28.95 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 		 248 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  36.23 
 
 		 163 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  28.46 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1866  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.806692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  29.25 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1367  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124047 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  26.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  27.2 
 
 		 132 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 144 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>