95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1228 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  43.05 
 
 
173 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  43.71 
 
 
173 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  47.79 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  46.67 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 
147 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  42.58 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 
144 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  32.82 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  38.95 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  23.73 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
137 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  35.65 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  35.64 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  30 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  35.44 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
179 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  35.64 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  27.88 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.07 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.31 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  30.38 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  30.53 
 
 
147 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
135 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  29.47 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  32 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  28.09 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  37.21 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  30.95 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  36.56 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  29.67 
 
 
158 aa  43.9  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  27.96 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  41.18 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.71 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  35.44 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  36.49 
 
 
156 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 
139 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
148 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  35.44 
 
 
145 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  35.05 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  34.07 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.84 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.84 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  37.7 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  37.84 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  26.27 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  32.08 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  34.31 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  21.8 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  24.75 
 
 
155 aa  40.8  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  26.88 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  24 
 
 
158 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>