72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2323 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 
154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2233  thioesterase superfamily protein  68.47 
 
 
121 aa  144  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
149 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  30.99 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  37.11 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32.28 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  40.79 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  32.2 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  33.63 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  33.63 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  33.64 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.08 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.58 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  27.69 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  31.43 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.77 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  33.01 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  33.01 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  33.06 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 
130 aa  44.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.1 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  27.13 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  39.68 
 
 
170 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 
139 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  29.67 
 
 
137 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  23.77 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  43.14 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  30.11 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  36 
 
 
179 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
142 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  31.31 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  38.81 
 
 
184 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  31.87 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
232 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  33.67 
 
 
131 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>