206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5764 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  45.76 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  42.4 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 137 aa  92  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  39.83 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  44.19 
 
 		 142 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  42.37 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  46.34 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  36.97 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  36.8 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  41.88 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  39.34 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  37.7 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  41.03 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  36.97 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  34.35 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  36.13 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  36.13 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  36.13 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  35.29 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  36.75 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  40.8 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  36.03 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  32.06 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  42.28 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  37.21 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.45 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  34.19 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  34.19 
 
 		 176 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  33.07 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  35.34 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.88 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  39.77 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3091  hypothetical protein  35.34 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.768762  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.64 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.64 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0110  phenylacetic acid degradation-related protein  30.34 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  39.05 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.03 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  36.61 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  35.59 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5821  thioesterase superfamily protein  37.93 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104468  normal  0.024751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  36.56 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  33.58 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  29.89 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  29.37 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>