257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0837 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  73.02 
 
 		 137 aa  200  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  48.36 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  43.41 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 148 aa  105  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  42.15 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  41.32 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  46.46 
 
 		 176 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  38.64 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  41.53 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  40.6 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  41.32 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  41.32 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  40.48 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  40.5 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  42.37 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  43.44 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  40.65 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  38.4 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  38.35 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  42.86 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  39.5 
 
 		 137 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  40.94 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  42.37 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  35.59 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  34.78 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.45 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  28.08 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  26.67 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  28.3 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  29.45 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.02 
 
 		 232 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.69 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  32.69 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.65 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  30.83 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  35.23 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  27.45 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  27.35 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  35.45 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  28.79 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  31.17 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>