More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0725 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 159 aa  326  6e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  48.57 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  48.2 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  53.72 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  48.57 
 
 		 187 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  52.89 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  44.72 
 
 		 191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  50.83 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  44.14 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  44.14 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  45.71 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 225 aa  120  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 		 204 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  47.93 
 
 		 189 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  47.93 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  46.72 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  46.15 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  48.84 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  44.29 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  46.26 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  46.26 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  41.84 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  46.26 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  44.9 
 
 		 145 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  41.84 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  45.03 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  44.83 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  46.1 
 
 		 232 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  44.9 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  44.9 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  42.14 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  44.06 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  44.76 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  44.14 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  44.14 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  44.14 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  44.14 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  44.14 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  44.37 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  38.19 
 
 		 142 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  41.3 
 
 		 209 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  42.25 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  43.45 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  43.84 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  43.45 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  41.43 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  45.38 
 
 		 189 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 		 165 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  41.84 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  41.13 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  41.67 
 
 		 146 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  38.19 
 
 		 145 aa  97.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  35.42 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  46.55 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.72 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3389  hypothetical protein  47.44 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.09 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  33.88 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  33.88 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  36.43 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  39.32 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  34.53 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  32.76 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  36.51 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  34.92 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  40.52 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  40.52 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.6 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  33.87 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  34.56 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  31.34 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>