278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2612 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
164 aa  330  5e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  41.36 
 
 
184 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  40.12 
 
 
170 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  38.12 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  40.76 
 
 
176 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
225 aa  118  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  46.04 
 
 
169 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.31 
 
 
191 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  43.88 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  36.31 
 
 
165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  41.73 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  45 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.85 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  37.01 
 
 
176 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.01 
 
 
176 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  38.99 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 
191 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  43.38 
 
 
204 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  41.18 
 
 
193 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  40.88 
 
 
185 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  35.17 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
181 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 
182 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  44.09 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  40.15 
 
 
139 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  40.88 
 
 
182 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  34.39 
 
 
232 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 
144 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
144 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 
144 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  39.13 
 
 
158 aa  94  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  36.17 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  40.62 
 
 
179 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  42.76 
 
 
155 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  38.3 
 
 
189 aa  90.9  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  32.52 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  35.57 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  33.1 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  34.48 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 
145 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  38.93 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
145 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  38.93 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.85 
 
 
153 aa  88.2  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  35.66 
 
 
167 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  32.41 
 
 
145 aa  84  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3308  hypothetical protein  29.25 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  34.93 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
144 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  31.03 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  35.42 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  35.9 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  35.9 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  27.14 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  33.1 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  33.1 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  33.1 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  33.1 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  36.57 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  32.41 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  32.8 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  30.7 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  34.4 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  28.44 
 
 
126 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
149 aa  57.8  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  29.55 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  32.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
138 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
132 aa  55.8  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  32.5 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  30.83 
 
 
132 aa  55.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0327  hypothetical protein  27.97 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000150784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.11 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>