More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2327 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  95.62 
 
 		 160 aa  313  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  87.5 
 
 		 159 aa  283  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  87.5 
 
 		 159 aa  283  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  87.5 
 
 		 159 aa  283  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  87.5 
 
 		 159 aa  283  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  87.5 
 
 		 159 aa  283  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  86.88 
 
 		 159 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  86.25 
 
 		 159 aa  278  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  82.07 
 
 		 161 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  76.88 
 
 		 161 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  75.97 
 
 		 157 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  58.54 
 
 		 144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  56.91 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  56.1 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  55.2 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  52.86 
 
 		 165 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  53.72 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  48.48 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  50.39 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  49.59 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  46.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  49.59 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  47.97 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  45.31 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  45.24 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  45.22 
 
 		 137 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 		 137 aa  97.4  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  40.5 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  41.74 
 
 		 144 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  40.91 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  39.67 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  34.71 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  39.84 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  36.97 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  33.91 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 145 aa  77  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.65 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  36.75 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  36.51 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.88 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  37.17 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  35.2 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  35.2 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.71 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  30.53 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  33.61 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  37.37 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  31.4 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.94 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  36.26 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  29.73 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  31.4 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>