182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1352 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 133 aa  270  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  95.38 
 
 		 131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  54.84 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  33.81 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  33.57 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  32.8 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  33.09 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  33.08 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  32.09 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  32.09 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  34.35 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  32.8 
 
 		 147 aa  57  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.37 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  29.75 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  28.68 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  31.01 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  32.28 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  37.62 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  30.28 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  30.48 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  33.07 
 
 		 167 aa  52.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  30.4 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  29.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  29.71 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1922  phenylacetic acid degradation-related protein  30.19 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  29.71 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  31.01 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  31.03 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  31.03 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  29.71 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 169 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  28.99 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.23 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  31.67 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  28.99 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 127 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  30.83 
 
 		 154 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  30.37 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  27.82 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  30.08 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>