More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1545 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
126 aa  253  5e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  52.85 
 
 
126 aa  143  9e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.71 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  37.14 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  35.48 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  37.61 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  35.9 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  32 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  32.32 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  29.17 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  37.1 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  39.34 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  31.63 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  38.26 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  32.76 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  30.3 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  30.51 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  33.62 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  39.73 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
156 aa  62.8  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  29.37 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  33.62 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  32.38 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 
232 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  27.05 
 
 
209 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
161 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 
159 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  30.43 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 
152 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4551  hypothetical protein  32.5 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.442079  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  38.98 
 
 
157 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  28.45 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3433  phenylacetic acid degradation-related protein  29.84 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  29.66 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  32.95 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  29.66 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  28.45 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  28.81 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  28.81 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.34 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  40.82 
 
 
152 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1857  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0499053  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
233 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>