124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2751 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 139 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  37 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  27.34 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  29.51 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 		 179 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  23.08 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  26.87 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  24.82 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  28.87 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  24.81 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  25.74 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  26.23 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  31.4 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2323  phenylacetic acid degradation-related protein  31.43 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  27.56 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  26.67 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.48 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  26.67 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  30.53 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  29.13 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  25.83 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.53 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6485  phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643148  normal  0.874167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.16 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2521  phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0358111  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3134  hypothetical protein  31.03 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.508903  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3131  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00791508  hitchhiker  0.00397515 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3150  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.178873 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3189  hypothetical protein  30.68 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000585851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3072  thioesterase superfamily protein  30.68 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.585462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  28.85 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  24.76 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  24.76 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0135  hypothetical protein  29.55 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0339  thioesterase family protein  29.55 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0121  hypothetical protein  29.55 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2815  thioesterase family protein  29.55 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.69052  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2267  hypothetical protein  29.55 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0141  thioesterase family protein  29.55 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.608917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0149  thioesterase family protein  29.55 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2344  thioesterase family protein  29.55 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  29.21 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4425  phenylacetic acid degradation-related protein  32.18 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.064517  normal  0.466839 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  30.48 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>