95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6911 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
128 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  35.59 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  35.59 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  34.68 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  28.12 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  27.12 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  28.81 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
139 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
137 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  26.45 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  32.38 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
153 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  24.78 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  36.62 
 
 
158 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  25.6 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.21 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  23.01 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  32.98 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  24.79 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.8 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  23.08 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  32.52 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  29.25 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  24.79 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  31.63 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1303  thioesterase superfamily protein  27.55 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  27.42 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  31.18 
 
 
153 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
146 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  25.81 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 
137 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  25.81 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  25 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  28.71 
 
 
150 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  27.42 
 
 
160 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  33.98 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  24.35 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  27.68 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  25.44 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  33.01 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  24.73 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  27.55 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  29.01 
 
 
191 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
162 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.138316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>