80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2019 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  100 
 
 		 166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  80.67 
 
 		 145 aa  233  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  79.33 
 
 		 145 aa  230  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  39.04 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  37.33 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  36.84 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  39.55 
 
 		 134 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  34.42 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 149 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  42.11 
 
 		 151 aa  85.1  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  38.1 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  32.59 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.56 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  29.01 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  26.87 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  23.94 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  34.91 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1431  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1395  thioesterase superfamily protein  41.43 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  30.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  35.64 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 127 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  22.54 
 
 		 139 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30.85 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 128 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5298  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  33 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  28.87 
 
 		 127 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0584  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  33 
 
 		 161 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  33 
 
 		 161 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  33 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  39.6 
 
 		 128 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 127 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  27.84 
 
 		 127 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  34 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  28.87 
 
 		 129 aa  40.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>