78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3633 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  41.46 
 
 		 178 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  31.51 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  30.82 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  34.69 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  30.14 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  32.21 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  32.86 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  34.23 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  31.15 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  31.06 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  30.99 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  27.73 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1781  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3715  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  27.97 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  25.21 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  22.5 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  25.6 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  27.42 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  26.43 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  27.84 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  35 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  33.67 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  23.02 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  25.83 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  24.53 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 145 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  26.88 
 
 		 149 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 160 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  26.53 
 
 		 161 aa  42  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  23.33 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  22.56 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  26.97 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  24.79 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 		 144 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1126  thioesterase superfamily protein  26.97 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>