277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2322 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2322  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
140 aa  280  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  43.41 
 
 
135 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  43.41 
 
 
135 aa  120  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  46.85 
 
 
151 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3214  phenylacetic acid degradation-related protein  42.98 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.590302  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1292  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.430842  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2242  phenylacetic acid degradation-related protein  42.98 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.298496  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3360  thioesterase superfamily protein  38.33 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199811  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4877  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
156 aa  80.1  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.48 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2706  hypothetical protein  29.6 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.183315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
191 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  32.81 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17390  Phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00857022  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  34.19 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0708  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422645  normal  0.817493 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  32.77 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
159 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  38.74 
 
 
179 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2042  hypothetical protein  29.57 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  35.2 
 
 
176 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4779  phenylacetic acid degradation-related protein  35.35 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 
191 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  35.16 
 
 
181 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  27.87 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  32.54 
 
 
193 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
155 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 
209 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4446  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  34.62 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  29.82 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  31.9 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
174 aa  57  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  35.64 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 
204 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 
182 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.6 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  25.83 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.6 
 
 
176 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  34.55 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
182 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 
146 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  27.69 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  32.54 
 
 
182 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  32.52 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  26.67 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  29.81 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  35.64 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
304 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  32.46 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1683  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.083684  normal  0.174772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
233 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  30.17 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
135 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  24.59 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  28.43 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  31.03 
 
 
128 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
135 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0284  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.719156  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  29.47 
 
 
139 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  34.95 
 
 
146 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  30.84 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  30.84 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  30.1 
 
 
147 aa  50.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2156  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  31 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  29 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>