74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4380 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4380  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 151 aa  304  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06200  hypothetical protein  47.29 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0140173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0580  hypothetical protein  44.72 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7099  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  36.36 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2019  signal peptide protein  42.11 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142293  normal  0.189866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1853  thioesterase superfamily protein  41.79 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.032605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2176  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.377953  normal  0.0193271 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2272  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.482211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4897  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3584  phenylacetic acid degradation-related protein  35.88 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.506828  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1982  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2975  thioesterase superfamily protein  31.29 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3633  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  31.39 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1883  phenylacetic acid degradation-related protein  33.59 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3220  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5020  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017397  normal  0.174353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2286  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2766  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0887  thioesterase superfamily protein  34.86 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114849  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5737  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00962069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4235  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00920206  normal  0.85972 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3334  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3164  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5013  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1737  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.052165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4340  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757793  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1457  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103359  normal  0.371567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1460  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.140224  normal  0.0193466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1228  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0931221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1871  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.67 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  28.46 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2054  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000754115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 		 161 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  37.97 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  33.68 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0492  thioesterase superfamily protein  23.45 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0596  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.764415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  30 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2234  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000268048  hitchhiker  0.0000000000429679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4479  thioesterase superfamily protein  35.87 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.306751  hitchhiker  0.00370817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1075  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0491  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5172  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556707  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10738  PaaI_thioesterase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04355)  31.52 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00650285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.73 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  29 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  33.05 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1078  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2224  thioesterase superfamily protein  26.21 
 
 		 140 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.43014  hitchhiker  0.00490969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3376  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  28.12 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2751  hypothetical protein  21.26 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.704277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  26.05 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1854  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  25.84 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  32.67 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  26.83 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0863  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317562  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.64 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  25.51 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 304 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  29.63 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  29.25 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>