113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04950  uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism  98.8 
 
 		 101 aa  170  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1299  thioesterase superfamily protein  41.35 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  36.22 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  33.07 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.8 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  32.81 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.03 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31.48 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  25.98 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  31.48 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  31.39 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01921  possible thioesterase protein  35.29 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.66 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.01 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  33.91 
 
 		 251 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.5 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.4 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.63 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.91 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.34 
 
 		 146 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.07 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.93 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  32.41 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.47 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  36.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1390  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1603  putative thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322772  normal  0.911093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  28.43 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  36 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.6 
 
 		 160 aa  48.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.98 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  43.3 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  43.3 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.7 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.1 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.1 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  43.3 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3094  thioesterase family protein  33.04 
 
 		 139 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  32 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.63 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1717  hypothetical protein  30.36 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350886 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  30.61 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.1 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.7 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0960  hypothetical protein  31.68 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.475825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2968  hypothetical protein  34.12 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00559031  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.42 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3719  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.670455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.95 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.95 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2763  thioesterase superfamily protein  28.85 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.44 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2494  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.721118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.2 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5298  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4342  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.331448  normal  0.342452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  35.05 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539.1  hypothetical protein  34.41 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0622463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.61 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.59 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.75 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  25.19 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  31.68 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  27.93 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1590  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  34.62 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4159  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 133 aa  43.5  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.588084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0851  thioesterase protein  30.65 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.501233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  27.27 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  34.78 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5402  hypothetical protein  38.46 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.925315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4386  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2429  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00959832  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6911  thioesterase superfamily protein  31.63 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.71 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1750  thioesterase superfamily protein  38.81 
 
 		 173 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 		 143 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 146 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>