29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04950 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04950  uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  98.8 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1299  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  35.37 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  36.47 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  35.37 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.29 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  36.71 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  35.37 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  35.37 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  35.37 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.21 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  34.18 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.75 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.05 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  28.4 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  31.17 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.84 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.41 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.41 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.41 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  34.88 
 
 		 155 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.41 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  32.5 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  35.37 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  29.27 
 
 		 132 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>