More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0286 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  274  4e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  47.24 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  48.06 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  43.55 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  43.48 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  42.02 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  40.16 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  40.87 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  41.88 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2351  hypothetical protein  46.22 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00694587  normal  0.0126121 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  31.45 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.31 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.87 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.39 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.13 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.39 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2874  phenylacetic acid degradation protein  39.13 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00122895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  39.66 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.13 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.44 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.27 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.19 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.84 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0445  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  32.5 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.55 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  35.83 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  35 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0512  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245476  normal  0.787837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.18 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3825  phenylacetic acid degradation protein PaaD  41 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.478257 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.38 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.83 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0902  phenylacetic acid degradation protein PaaD  44.09 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3719  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.670455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.24 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.05 
 
 		 164 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1079  thioesterase superfamily protein  40.34 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.17 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.19 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.54 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.19 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  40.4 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.25 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.89 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.82 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.19 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.117185  normal  0.261303 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.71 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3943  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.04 
 
 		 152 aa  67  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.545833 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 		 130 aa  66.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.24 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  35.51 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1924  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.082152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3489  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.34 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00562362  hitchhiker  0.000228083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  35.48 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.04 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  33.33 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1371  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.85 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.154408  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0467  phenylacetic acid degradation- related thioesterase (PaaI)  34.34 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1448  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  0.0181319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2476  phenylacetic acid degradation protein PaaD  38.61 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1510  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.63 
 
 		 155 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  30.25 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  33.88 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.99 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  39.05 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2696  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.24 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165626  hitchhiker  0.00035972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  33.06 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.35 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  39.05 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.94 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  31.11 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3202  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  39.05 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>