165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1143 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1469  hypothetical protein  62.2 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00236791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.67 
 
 		 149 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  31.11 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.63 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.63 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.95 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.95 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.95 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.95 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.08 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.58 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.71 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.71 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  31.07 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.32 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  36.76 
 
 		 199 aa  52  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.03 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  31.48 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  30.51 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  31.48 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  30.39 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  28.16 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.56 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  28.89 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0944  hypothetical protein  28.18 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00659595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0963  hypothetical protein  28.18 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000957659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.3 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.07 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  36.36 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  30.69 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  31.78 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  23.2 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.04 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  29.29 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.85 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 232 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  27 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.57 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.95 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.78 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02769  hypothetical protein  27.45 
 
 		 169 aa  45.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.76 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.93 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2565  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.69 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0540  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.69 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460721  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.67 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3627  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.7 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0218071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.65 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5533  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.68 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  24.27 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  33.72 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  27.35 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0530  ComA2 family protein  24.55 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184702  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  25.38 
 
 		 147 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0027  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0243965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  29.73 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2481  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.99 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000323431  hitchhiker  0.00762361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  36.49 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3526  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>