97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1469 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1469  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  257  3e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00236791  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  62.2 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2579  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.32 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3607  thioesterase superfamily protein  32.04 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
133 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  35.19 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2002  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.94 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.91 
 
 
140 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.91 
 
 
140 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.91 
 
 
140 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.91 
 
 
140 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  27.59 
 
 
144 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.02 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.52 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.41 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.96 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.03 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  26.88 
 
 
161 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05295  hypothetical protein  33.8 
 
 
136 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.702585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  26.96 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  30.39 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1977  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2491  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.554624  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.57 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
183 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  34.83 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  29.35 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1650  thioesterase superfamily protein  24.76 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278043  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28.57 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  29.67 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
176 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
148 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  0.00000500183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  28 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  28 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  30.85 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  28.97 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1893  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
225 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.333222  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  25.51 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01900  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21020  uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism  29.09 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  35.09 
 
 
137 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  25.86 
 
 
161 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1107  phenylacetic acid degradation-related protein  25.71 
 
 
145 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1587  hypothetical protein  25.71 
 
 
145 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  25.51 
 
 
136 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
128 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  27.62 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.06 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0297  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.77 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  24.76 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0223  thioesterase superfamily protein  30.14 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.103741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2725  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1223  hypothetical protein  23.42 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2002  thioesterase family protein  23.42 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4725  phenylacetic acid degradation-related protein  25.71 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0796  thioesterase family protein  23.42 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383566  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1848  thioesterase family protein  23.42 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0365  hypothetical protein  23.42 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1708  hypothetical protein  23.42 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.361715  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1483  hypothetical protein  25.71 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  28.3 
 
 
185 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1503  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  26.44 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  29.58 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1564  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  24.49 
 
 
136 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  26.85 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1835  thioesterase family protein  23.42 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  32.18 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  30.17 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  32.18 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  26.85 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 
149 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  31.73 
 
 
156 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  23.89 
 
 
189 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>