201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1780 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1780  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21020  uncharacterized protein, possibly involved in aromatic compounds catabolism  38.35 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  32.23 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.63 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  30.95 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5041  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11875  hypothetical protein  32.17 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0963448  normal  0.270095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
128 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.08 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3281  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.45 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
176 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1469  hypothetical protein  25 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00236791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2478  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.15 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.35 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3085  hypothetical protein  29.36 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.715187  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2615  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.518393  normal  0.199542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1237  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.75 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0826  phenylacetic acid degradation-related protein  28 
 
 
191 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  27.91 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  29.41 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3484  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
134 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1677  hypothetical protein  30.93 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0569  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.68 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0682  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.31 
 
 
158 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2808  phenylacetic acid degradation-related protein  29.36 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2852  hypothetical protein  29.36 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453308  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2835  hypothetical protein  29.36 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  26.13 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  28.1 
 
 
176 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  28.1 
 
 
176 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.69 
 
 
154 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  32.79 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  31.09 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  30.7 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_004310  BR1736  hypothetical protein  29.9 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0873993  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  25.64 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2529  phenylacetic acid degradation-related protein  30.28 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0273  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0676249  normal  0.122372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.63 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  31.62 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  27.83 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3366  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.94 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  27.56 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3098  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.71 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  35.35 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.43 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  37.63 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  29.09 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
182 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3104  thioesterase superfamily protein  30.69 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.399378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.25 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  26.56 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  23.36 
 
 
161 aa  47  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  0.00000000176552 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.7 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
232 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.23 
 
 
149 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
182 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.7 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.7 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.7 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  31.11 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.82 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  28.43 
 
 
136 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  31.82 
 
 
251 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  30.25 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.03 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2759  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0533783  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  26.36 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1660  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.67 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.388826  normal  0.270829 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  24.14 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  27.36 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.86 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>