More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0130 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  64.34 
 
 		 135 aa  180  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3983  thioesterase superfamily protein  64.34 
 
 		 135 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000686443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  34.55 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.77 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.08 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.08 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.08 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.08 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  31.15 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1469  hypothetical protein  31.15 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00236791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1868  hypothetical protein  30.17 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0606693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  31.15 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  30.93 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.64 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.01 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  34.19 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  32.5 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2612  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000610036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  35 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.12 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  34 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  32.74 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  34 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  34 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  34.44 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  32.8 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  33 
 
 		 238 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  33 
 
 		 374 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  30.36 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0561  hypothetical protein  31.73 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  33 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  34.75 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  29.17 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8061  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 184 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  27.93 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  34.29 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.54 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3697  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  33.63 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  29.47 
 
 		 435 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  32.04 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3395  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3470  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3593  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.741645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0892  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.915602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3883  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000319228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3031  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.499419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0943  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463398  normal  0.321033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0985  phenylacetic acid degradation protein  33.33 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.594777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  29.2 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  33.05 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3610  phenylacetic acid degradation-related protein  41.33 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000337364  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1824  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.177937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  32.56 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  31.46 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4159  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.588084  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376008  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0021  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0636  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1949  hypothetical protein  29.91 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.0384991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  32.71 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0906  hypothetical protein  30.08 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.398679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3192  hypothetical protein  30.08 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.345039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2944  hypothetical protein  29.91 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  27.43 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  27.87 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>