188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0316 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0316  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4591  hypothetical protein  95.3 
 
 
150 aa  291  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3025  thioesterase superfamily protein  76.64 
 
 
146 aa  225  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0281155  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4623  thioesterase superfamily protein  75.18 
 
 
144 aa  222  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  75.18 
 
 
145 aa  218  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  75.18 
 
 
145 aa  218  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  75.18 
 
 
145 aa  218  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  48.59 
 
 
148 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.48 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
128 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  31.25 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  30.95 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  33.09 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4071  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  36.26 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  32.74 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  29.6 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2271  hypothetical protein  27.12 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.641276  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
176 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  28.78 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  34.94 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  29.63 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1895  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
129 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  31.03 
 
 
209 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 
147 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  31.68 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  25 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 
191 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  33 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2311  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  31.68 
 
 
248 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  26.55 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
181 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  30.51 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  29.7 
 
 
238 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  31.37 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  30.99 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1515  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  25.83 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  29.31 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  28.16 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1904  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.148319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
213 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
179 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  27.93 
 
 
155 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2095  hypothetical protein  30.3 
 
 
128 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117378  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  28.28 
 
 
146 aa  47  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2032  hypothetical protein  30.3 
 
 
128 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2049  phenylacetic acid degradation-related protein  30.3 
 
 
135 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
150 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  35.37 
 
 
139 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  21.95 
 
 
189 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  32.22 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  29.27 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  26.73 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  30.26 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  27.38 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1616  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
150 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0296147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  27.86 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>