More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0301 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  260  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  52.85 
 
 		 126 aa  143  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  41.09 
 
 		 158 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  34.15 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  39.64 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  33.88 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  34.48 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 213 aa  70.1  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  34.17 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  35.79 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  32.52 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  35.34 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  35 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  43.02 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0331  hypothetical protein  32.06 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1251  phenylacetic acid degradation-related protein  29.75 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  32.52 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  30.58 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0365  hypothetical protein  30.08 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  31.4 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1149  phenylacetic acid degradation-related protein  28.93 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.648616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4242  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  33.01 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3591  hypothetical protein  30.08 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3764  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.337752 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  34.26 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.01 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  34.95 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  31.3 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  35.96 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  30.89 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  31.3 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3475  hypothetical protein  30.6 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.523059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  32.8 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  37.82 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  37.82 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  37.82 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  30.89 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.71 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  28.57 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  30.89 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  37.82 
 
 		 177 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0408  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000864765 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0394  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00040672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0382  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0383  hypothetical protein  30.53 
 
 		 154 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.242451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0390  hypothetical protein  28.36 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3083  phenylacetic acid degradation-related protein  36.59 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  37.1 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  29.27 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  37.82 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  37.82 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>