245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1432 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
213 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  44.36 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
157 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
141 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
138 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 
155 aa  97.8  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 
144 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  39.42 
 
 
147 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 
147 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  44.53 
 
 
158 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  41.48 
 
 
144 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  40 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  40 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
147 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 
152 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  42.22 
 
 
153 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  39.42 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  45 
 
 
132 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  40.46 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  39.42 
 
 
374 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  40.46 
 
 
177 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  40.46 
 
 
147 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  40.46 
 
 
177 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  40.46 
 
 
177 aa  92  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  41.56 
 
 
163 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  40.31 
 
 
148 aa  91.7  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  39.55 
 
 
148 aa  91.7  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 
162 aa  91.3  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
138 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
153 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  39.42 
 
 
146 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  43.59 
 
 
159 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  44.44 
 
 
147 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  43.2 
 
 
137 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  39.17 
 
 
148 aa  85.5  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  37.88 
 
 
140 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  36.09 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  36.09 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  37.39 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  39.37 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  44.64 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  37.82 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  36.44 
 
 
151 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  37.29 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  72  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  37.82 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
142 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  34.62 
 
 
141 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.77 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  35.11 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  36.52 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  45.37 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
126 aa  64.3  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  39.81 
 
 
145 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
176 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
141 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  37.01 
 
 
181 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  37.5 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
128 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  36.52 
 
 
138 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
127 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  32.23 
 
 
139 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  34.43 
 
 
132 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  36.52 
 
 
124 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  32.69 
 
 
147 aa  55.5  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
159 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  38.3 
 
 
139 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
132 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  38.95 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1025  phenylacetic acid degradation-related protein  31.06 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.61355  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2923  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
147 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
127 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3908  hypothetical protein  31.91 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
136 aa  52.4  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  32.31 
 
 
161 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  34.31 
 
 
147 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  33.86 
 
 
127 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
127 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
127 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  35.04 
 
 
147 aa  51.6  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
146 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
140 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  32 
 
 
159 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  35 
 
 
107 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>