179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1194 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1194  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149341  normal  0.623252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1314  hypothetical protein  85.91 
 
 		 153 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0101  phenylacetic acid degradation-related protein  79.56 
 
 		 148 aa  226  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2655  hypothetical protein  88.28 
 
 		 132 aa  227  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5037  putative thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  69.86 
 
 		 146 aa  209  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230571  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3041  phenylacetic acid degradation-related protein  68.31 
 
 		 148 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0730  thioesterase superfamily protein  71.53 
 
 		 155 aa  196  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0326  hypothetical protein  46.15 
 
 		 185 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0359  hypothetical protein  46.15 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.360225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0493  hypothetical protein  49.26 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5992  thioesterase superfamily protein  47.18 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179712 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3056  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0134  phenylacetic acid degradation-related protein  47.86 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4202  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000106672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  49.64 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4573  thioesterase superfamily protein  44.36 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4310  thioesterase superfamily protein  44.36 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0329  hypothetical protein  42.75 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3519  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 		 169 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.860046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0081  hypothetical protein  42.54 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0692  hypothetical protein  46.51 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  44.53 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4191  phenylacetic acid degradation-related protein  49.15 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  40.28 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1441  hypothetical protein  39.71 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1117  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.692478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  44.62 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1073  hypothetical protein  41.43 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0989  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1432  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 		 213 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1379  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 166 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23835  normal  0.28314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0164  thioesterase superfamily protein  36.88 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.759216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4126  hypothetical protein  36.97 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6909  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.343091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1902  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  34.92 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4835  hypothetical protein  37.21 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5381  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.466948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0974  phenylacetic acid degradation-related protein  36.7 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.405834  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2221  phenylacetic acid degradation-related protein  42.97 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2953  phenylacetic acid degradation-related protein  34.75 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4304  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0697  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12470  hypothetical protein  48.91 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3624  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0156  phenylacetic acid degradation-related protein  34.11 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133361 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000488962  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5359  phenylacetic acid degradation-related protein  34.11 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5501  hypothetical protein  34.11 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.555185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4770  thioesterase superfamily protein  34.11 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1740  hypothetical protein  38.05 
 
 		 248 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0904  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1866  hypothetical protein  32.88 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.698964  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  34.48 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0875  hypothetical protein  32.88 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1162  hypothetical protein  32.88 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0386  hypothetical protein  37.72 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.457677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0292  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2185  hypothetical protein  39 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3292  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0328311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2042  aromatic catabolism protein-like protein  35.66 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689399 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4483  putative Phenylacetic acid degradation-related protein  32.81 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0649427  normal  0.0189847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5196  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.156162  normal  0.866385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1137  hypothetical protein  44.23 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113498  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3458  phenylacetic acid degradation-related protein  38.64 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.887752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.29 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1701  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0708243  normal  0.927888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 232 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  32.73 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  38.64 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2571  hypothetical protein  45.16 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163005  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_808  thioesterase  27.45 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0821  thioesterase superfamily protein  27.45 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1719  Uncharacterized protein possibly involved in aromatic compounds catabolism  41.03 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3222  phenylacetic acid degradation-related protein  28.3 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.663153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3284  hypothetical protein  28.3 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3233  hypothetical protein  28.3 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245509  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2868  thioesterase superfamily protein  32.18 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  30.83 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4384  hypothetical protein  43.02 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.359887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2901  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1947  phenylacetic acid degradation-related protein  35.29 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2211  thioesterase superfamily protein  24.44 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0937  thioesterase family protein  28.43 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0346835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1993  hypothetical protein  38.3 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.762043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0703  hypothetical protein  38.3 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2124  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.172175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  30.11 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4114  phenylacetic acid degradation-related protein  37.23 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  32.63 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  32.47 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2628  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45641  normal  0.0525731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>